ეგვიპტის ისტორიული პერიოდი დაიწყო მესამე და მეოთხე ათასწლეულების მიჯნაზე ქრისტეს შობამდე. უძველესი კულტურული ტრადიცია, რომელიც განიცდიდა დამპყრობლების გავლენას და შიდა აჯანყებებს, გაგრძელდა ქრისტიანობის მიღებამდე IV საუკუნეში. თითქმის სამნახევარი ათასი წლის განმავლობაში ეგვიპტური ღმერთების სიამ და ფუნქციებმა მნიშვნელოვანი ცვლილებები განიცადა. ეგვიპტურმა ღმერთებმა შეიძინეს მეზობლებისთვის დამახასიათებელი ნიშნები და სახელები - ასურელებისთვის, ხეთებისთვის, ჰიქსოსებისთვის, ელინებისთვის.
ეგვიპტის ერთიანი მმართველის მმართველობის ქვეშ გაერთიანების შემდეგ, ქვეყნის ცალკეული რეგიონებისა და ტომების მრავალი ღმერთი შევიდა საერთო პანთეონში, მაგრამ მათ უმეტესობას პატივს სცემდნენ მხოლოდ იმ გარემოში, სადაც მათი კულტი წარმოიშვა. ზოგიერთმა ღმერთმა თანდათან შეიძინა საერთო ეგვიპტური მნიშვნელობა. ქალღმერთი ბასტეტი, რომელსაც კატის თავი აქვს, უდავოდ წარმოიშვა კატების, როგორც თაგვების მარცვლეულის მცველების თაყვანისცემის კულტიდან. ეგვიპტეში დიდი როლი ითამაშა სოფლის მეურნეობამროლი, განსხვავებით, მაგალითად, ჰელასისგან, რომელიც გაიზარდა ძირითადად ვაჭრობისა და სამხედრო დაპყრობების გამო. ანთროპომორფული ეგვიპტური ღმერთები ხშირად იყვნენ დაჯილდოვებულნი ცხოველის თავით, რომლის თაყვანისცემის საფუძველზე წარმოიქმნა ესა თუ ის კულტი. მაგალითად, ღმერთ თოთს ჰქონდა იბისის თავი, ქალღმერთ სოხმეტს (სეხმეტს) ჰქონდა ლომის თავი, ანუბისს ჰქონდა ძაღლის თავი.
ქვეყნის გარკვეული უბნების აღზევებასთან ერთად მოხდა დინასტიების შეცვლა ან დედაქალაქის "გადატანა" ახალ ადგილას, შეიცვალა "პირველი ეშელონის" ეგვიპტური ღმერთებიც. ძველი ეგვიპტური რელიგიის საინტერესო თვისება იყო კოსმოგონიური მითების (ანუ სამყაროს წარმოშობის ვერსიების) დიდი რაოდენობით არსებობა და თითოეულ ლოკაციაში ადგილობრივი ღვთაება მთავარ როლს თამაშობდა ამ რთულ საკითხში..
ეგვიპტური ღმერთები ასეთი დიდი რაოდენობით, რომლებიც იქცნენ ადგილობრივი სეპარატიზმის საფუძველი, უეჭველია, არც ერთ ქვეყანას არ სჭირდებოდა. გარდა ამისა, მრავალი კულტი მოითხოვდა დიდი რაოდენობით მატერიალური რესურსების ხარჯვას, რაც შეიძლებოდა გაცილებით დიდი სარგებლით დახარჯულიყო ქვეყნის შიდა მოწყობაზე, ჯარის შენარჩუნებაზე და ა.შ. დიდი სიმდიდრისა და გავლენის მქონე სამღვდელო კლანები პირდაპირ ემუქრებოდნენ ფარაონის ერთპიროვნულ ძალას.
ყველაფრის გათვალისწინებით, ფარაონი ამენჰოტეპ IV, ეხნატონის სახელით, შემოაქვს მცირე რეგიონალური ღვთაების ატონის (გაღმერთებული მზის დისკის) კულტს, როგორც საერთო ეგვიპტურ რელიგიას. მაგრამ ტრადიციის ინერცია ძალიან ძლიერი იყო და ეხნატენი ორმოცი წლის ასაკამდე კვდება. ყველაზე დამაჯერებელი ვერსიით ის იყომოწამლული. მართალია, დევნა ოჯახს არ შეხებია და მისი მეუღლე (ცნობილი ნეფერტიტი) ქმრის გარდაცვალებიდან მრავალი წლის შემდეგ ცოცხალი დარჩა.
ქვეყანის სპარსელთა და მოგვიანებით ელინთა ხელში ჩაგდების შემდეგ, ეგვიპტური ღმერთები და ქალღმერთები თანდათან იწყებენ ადრინდელი გავლენის დაკარგვას, დაცემას. ისინი ერწყმის დამპყრობლების ღმერთებს. მაგალითად, ალექსანდრე მაკედონელს ეგვიპტეში პატივს სცემდნენ, როგორც ზევს-ამონის, სინკრეტული ეგვიპტურ-ელინისტური ღვთაების ძეს.
როდესაც ეგვიპტურმა ღმერთებმა, რომელთა სახელებს ჰქონდათ როგორც ადგილობრივი, ასევე შერეული წარმოშობა, დაიწყეს ადგილის დათმობა ახალ რელიგიას - ქრისტიანობას, თანდათან დაიწყო ძველი ეგვიპტური დამწერლობის დავიწყება. იმპერატორ კონსტანტინეს მეფობის დროს გარდაიცვალა ეგვიპტური რელიგიური ტრადიციის უკანასკნელი მატარებელი, რის შემდეგაც მრავალი საუკუნის განმავლობაში ძველი ეგვიპტური ღმერთების სახელები ცნობილი იყო მხოლოდ ბერძენი და რომაელი ისტორიკოსების ნაწერებიდან. მაგრამ ორივე მათგანი ეგვიპტურ კულტურას გაეცნო იმ დროს, როდესაც ის უკვე კლებულობდა და ნაკლებად სავარაუდოა, რომ მღვდლები უცხოებს (ხშირად აგრესიულებს) თავიანთი რელიგიის საიდუმლოებაში აეყვანათ.
ძველი იეროგლიფების გაშიფვრის მცდელობები არაერთხელ გაკეთდა როგორც არაბი მეცნიერების, ისე ევროპელების მიერ, მაგრამ უშედეგოდ. და მხოლოდ მეცხრამეტე საუკუნის დასაწყისში, ბრწყინვალე ლინგვისტმა ფრანსუა შამპოლიონმა მოახერხა ეგვიპტური ტექსტების გაშიფვრის გასაღები. ამ მომენტიდან დაიწყო ძველი ეგვიპტის ისტორიისა და კულტურის შესწავლის თანამედროვე ერა.
